progenes


Понятно о непонятном


Previous Entry Share
Слово к новым читателям.
progenes
Я смотрю, постепенно журнал переходит в новое качество. Читателей в последнее время заметно прибавилось, чувствую, что надо внести некоторую ясность.
Я посмотрела критично на содержание своего журнала и обнаружила, что он чудесным образом покрывает большинство из 25-ти главных научных вопросов, которое человечество запланировало решить в ближайшие пол-века. Эти 25 вопросов из 125 сформулировало научное комьюнити в 2005 году к 125ти летнему юбилею Журнала Science. Итак, о что же это завопросы.

(Линки ведут на статьи или циклы статей в этом журнале, освещающие проблематику)
1. What Is the Universe Made Of? Из чего состоит Вселенная.
2. What is the Biological Basis of Consciousness? Каковы биологические основы сознания.
3. Why Do Humans Have So Few Genes? Почему у людей так мало генов?
4. To What Extent Are Genetic Variation and Personal Health Linked? Насколько индивидуальные особенности человека важны для лечения – проблема "персональной медицины", учитывающей генетический код человека.
5. Can the Laws of Physics Be Unified? Можно ли объединить все законы физики.
6. How Much Can Human Life Span Be Extended? На сколько можно увеличить продолжительность жизни.
7. What Controls Organ Regeneration? Как происходит регенерация органов.
8. How Can a Skin Cell Become a Nerve Cell? Дифференциация клеток.
9. How Does a Single Somatic Cell Become a Whole Plant? Внеполовое размножение растений соматическими клетками.
10. How Does Earth's Interior Work? Что происходит в недрах Земли.
11. Are We Alone in the Universe? Мы одни во Вселенной?
12. How and Where Did Life on Earth Arise? Когда и где зародилась земная жизнь.
13. What Determines Species Diversity? Видовое разнообразие
14. What Genetic Changes Made Us Uniquely Human? Какие генетические особенности делают человека человеком.
15. How Are Memories Stored and Retrieved? Как мозг хранит и "читает" воспоминания.
16. How Did Cooperative Behavior Evolve? Поведенческая биология.
17. How Will Big Pictures Emerge from a Sea of Biological Data? Системная биология.
18. How Far Can We Push Chemical Self-Assembly? Химический синтез самовоспроизводящихся молекул.
19. What Are the Limits of Conventional Computing? Теоретические пределы возможностей компьютера.
20. Can We Selectively Shut Off Immune Responses? Можно ли блокировать реакции иммунной системы.
21. Do Deeper Principles Underlie Quantum Uncertainty and Nonlocality? Квантовая физика.
22. Is an Effective HIV Vaccine Feasible? Можно ли создать вакцину от СПИДа.
23. How Hot Will the Greenhouse World Be? Чем грозит глобальное потепление.
24. What Can Replace Cheap Oil -- and When? Чем нам заменить нефть.
25. Will Malthus Continue to Be Wrong? Рост населения Земли и ограниченность ресурсов.

В будущем собираюсь в журнале оперативно информировать, как продвигается наука в решении этих нелегких задач, а также указывать, если наука заблудилась или кто из ученых ударилась в шаманство.
Пару слов про политику френдования: из вежливости френдить не буду. Но если кому важно, дайте знать. Если кого зафрендил сама, точно так же не ожидаю немедленного френдования в ответ.

Избранные статьи:
Правда про L-карнитин.
Правда про косметические препараты.
О ГМО vs. традиционная селекция.
Почему я ощущаю, что ты ощущаешь.
Об особенностях развития мозга от зачатия до подросткового возраста.
Почти все о фирмах, секвенирующих геном человека.
Все о биодизеле.
Все, что вы хотели знать про ушную серу, но стеснялись спросить.
Почему на бровях короткие волосы.
Про научные подходы в молекулярной биологии на пальцах.
Все, что вы хотели знать про жиры.
А также про жиры и атеросклероз.

Цикл про ГМО:
Часть 1. Вступление
Часть 2. Фирмы и фермеры
Часть 3. Нестабильная стабильность
Часть 4. Судьба ДНК в пищеварительном тракте и горизонтальный перенос генов
Часть 5. ГМО и прозрачность
И вообще, про ГМО я регулярно вещаю по тегу.
Еще несколько базовых историй про ГМО, которые не вошли в цикл.
ГМО и плазмиды.
ГМО и бабочка Монарх.

Важные сайты и статьи на тему допусков и законодательств касательно ГМО.
Guidance for risk assessment of food and feed from genetically modified plants (EFSA Panel on Genetically Modified Organisms) pdf
Approvals of GMOs in the European Union (Analysis • Global Comparison • Forward Projection • Impacts • Improvements) pdf
A decade of EU-funded GM research  (отчет исследований рисков ГМО за десятилетний период в Европе) pdf
Transgenic Plants for Food Security in the Context of Development (Study Week on Invitation of the Pontifical Academy of Sciences, Vatican City, May 15 – 19, 2009) pdf
The Impact of Genetically Engineered Crops on Farm Sustainability in the United States (отчет исследований рисков ГМО за десятилетний период в Америке) web
The monitoring report of the biotechnology adopted in the 2011/12 crop period in Brazilia pdf
GMO compass (сайт для информирования европейских потребителей о ГМО) web
GM Approval database ISAAA (the International Service for the Acquisition of Agri-biotech Applications)


Охотникам за научными блоговыми новостями вовсе не обязательно серфить по всему рунету. Игорь Топильский создал агрегатор научных блогов рунета http://cmass.ru/ . Сайт включен в http://scienceblogging.com/ (в самом низу, последний). Это тоже агрегатор научных блогов, но с приставкой мега - там идет лента вообщех научных блогов на планете на всех языках - проект главного редактора Research Blogging Дейва Мангера и Боры Живковича.

Русскоязычные научно-популярные журналы.
Элементы. ру
Мембрана. ру
STRF.ru
Биомолекула. ру
Троицкий вариант. Наука.

Другие естественно-научно-популярные и околомедицинские блоги ЖЖ:
shvarz - вирусолог, uncle_doc - врач, медицинское просвещение, nature_wonder - популяризация науки, ivanov_petrov , botalex -врач, вакцинация, любительская энтомология, macroevolution - эволюционист, wolf_kitses - этолог, plakhov , afranius - палеонтолог, kouprianov -история науки, shao_s - нейробиолог, tanchik - иммунолог, scinquisitor - популяризация науки, velta_1 - микробиолог, algebraic_brain - утверждает, что не математик, но врет (куда-то переехал, очень жаль), larkinvalley - популяризация науки, lenka_iz_hij - популяризация науки, asena - популяризация науки, gutta_honey - невропатология, под тэгом "спрашивали" user_mz - популяризация науки, yuretz73 - астроном, sergepolar - астроном, популяризация науки, flavorchemist - популяризация науки, пожалуй единственный в своем роде познавательный блог физика Блог Игоря Иванова
 «Антропогенез.ру» (представительство в ЖЖ — chieffff). Сайт «Элементы.ру» и его трансляция в ЖЖ: elementy_news.(Если кого пропустила, подсказывайте)


Потенциальным рекламодателям: этот бложик для размещения рекламы безнадежно бесперспективный. Предложения не рассматриваются и не принимаются.

  • 1
Ну не то, чтобы не помогло, просто я тут стою перед нелегкой для меня задачей Array Submisiion http://www.ebi.ac.uk/microarray/submissions_overview.html. Существует два пути: один WEB-based и Spreadsheet submission c MAGE/ML. И я даже не знаю, какой более геморройный. Когда-то с помощью одного биоинформатика мы submitted MAGE/ML file и это был ужас-ужас-ужас, потому что наш файл был нифига не компартибл и это длилось 2 (два) месяца с интенсивной перепиской. Теперь этого биоинформатика нет и ни одна сволочь на весь институт не знает, как это делать. Но когда я смотртю на WEB-based, мне еще страшнее. А надо, как всегда, срочно, потому что статья уже в редакторской читке и до публикации надо предоставить аксешн намбер из этого Array Express.

к сожалению, все интерфейсы EBI очень недружественны к пользователю. раз проблема такая конкретная, то стоит обратиться не к главному, а к кому-то, кто разрабатывал веб-интерфейс, предположительно это George Tsun-Po Yang (tsunpo(а)ebi.ac.uk) или Niran Abeygunawardena (nira(а)ebi.ac.uk). типа "так и так, есть данные в таком-то формате, никак не можем понять, как их засабмитить через веб-интерфейс, который для нас уникальная возможность и последняя надежда" ;-)

хотя два месяца - это страшно...

О! так и сделаем! Прикинусь блондинкой, отправлю MAGE/ML в первозданном виде и на все вопросы буду хлопать ресницами. Просто веб-интерфейс я посмотрела, это значительно хуже, чем я предполагала.

ArrayExpress (EBI)

кстати, чем все закончилось? :-)

Re: ArrayExpress (EBI)

Успешно! http://www.ebi.ac.uk/microarray-as/ae/browse.html?keywords=+E-MEXP-1555

Как я и предполагала, с наскока сабмишн у меня не получилась. Я написала письмо на деревню дедушке, как Вы и посоветовали и уже на другой день со мной связалась сотрудница, которая помогала мне прорваться сквозь дебри.

  • 1
?

Log in